對於細菌性肝膿腫，患者常見的早期症狀包括髮燒，即體溫升高，以及右上腹脹痛、上消化道消化不良、黃疸等表現。細菌性肝囊腫患者血液或膽汁內的細菌進入肝臟某部位，如肝葉、肝段，隨著患者抵抗力下降而大量增殖，進而形成反應性炎症。由於肝臟的血液較豐富，隨著患者抵抗力的增加，可能侷限於某一處肝組織而形成包裹性炎症，炎症中心出現壞死、積液，進而患者會表現為發燒，體溫達到38℃，甚至在39℃以上。

此外，患者可出現腹痛，通常由於膿腫侵犯肝臟被膜所致。另外，膿腫還會引起全身的炎性反應，進而消影響化道，出現進食後的飽脹不適、食慾減退，部分患者可以表現為肝功能損害而出現黃疸。因此，當患者出上述現象後，應及早進行消炎對症引流，將膿腫壞死、積液引流，屬於徹底治療肝膿腫的辦法。