小兒腦腫瘤的手術費用與腫瘤的類型、位置、大小、病程等相關，手術費用一般不菲。

普通的膠質瘤比複雜的腫瘤費用要低，如果合併其它疾病，手術可能需要分期進行，費用就更高,，而且依據患者體質、治療方法、醫院等級的不同，費用也會有比較大的差異。主要包括手術操作費、床位費、治療費、手術前的檢查以及手術後的檢查、手術的麻醉費、術後的藥物等等，故每個患者的手術費用存在較大的差異。有的病人腫瘤比較複雜，對病人來說影響比較大，術後需要去重症監護室，這種病人的費用就會多一些；部分病人做完以後完全清醒，拆線出院非常順利，這一部分病人費用相對低一些。

複雜部位的腫瘤若為腦深部腫瘤，與周圍組織關係密切，手術時間長，損傷範圍大，圍手術期恢復緩慢，醫療費用可能更大。對於住院時間長、在重症監護室待的時間長的病人，這部分費用可能會更高。