腦腫瘤形成的原因和身體其它部位的腫瘤形成原因相似，即由基因突變所造成的正常腦部細胞突變成腫瘤細胞，細胞的生長不受控制，從而演變成腫瘤。造成細胞突變的因素包括外部因素和內部因素，外部因素常見的有環境汙染、電離輻射和病毒感染等。由於現代社會的環境汙染越來越嚴重，人體會攝入有毒的化學物質，從而造成細胞突變。電離輻射也是一大因素，常見的有放射性損傷以及長時間的無線電通話等，有可能會造成細胞突變。

內部因素主要包括遺傳因素，及機體免疫力下降等。遺傳因素也是造成腦部腫瘤的一大因素，很多腦部腫瘤都是由遺傳所造成。免疫力下降會使得腫瘤細胞產生免疫逃避，從而演變成腦部腫瘤。