很多膽總管下段結石不會消失，偶有很小的膽總管下段結石會自行排出。很小的結石指直徑在0.5cm以下的結石，大部分膽總管下段結石會卡在Oddi括約肌無法排出。而膽總管下段結石發生嵌頓後，可能會引起黃疸、疼痛。

膽總管下端結石嵌頓以後，可通過ERCP，即通過內鏡從Oddi括約肌到膽管取石。如果結石很多、很大，或者肝內有結石，這時需要進行微創手術治療，把膽總管打開之後取出膽總管下段的結石。