急性胰腺炎的主要原因是膽管結石或膽囊結石，其佔急性胰腺炎發病率的50%以上。膽管結石引起的胰腺炎，實際與膽管和胰管的生理解剖存在關係。膽總管向下移行至十二指腸壺腹位置時，與胰管匯合，兩根管道合併形成共同通道，穿過十二指腸壁進入十二指腸內，開口於十二指腸大乳頭。

因為該特殊的生理解剖結構，故只要出現膽管結石，尤其是小顆粒狀或泥沙樣結石，一旦卡在共同通道，就會造成膽汁和胰液排出不暢。膽汁排出不暢會出現膽道系統的相關症狀，如發熱、黃疸及腹痛。結石若影響胰液排出會造成胰腺炎，引起胰管高壓，同時膽汁可能逆流進入胰管系統，激活胰酶而出現急性胰腺炎的情況，所以膽源性胰腺炎是較常見的胰腺炎的一種。