EST手術比較成熟，相對比較安全，其手術併發症具體如下：

1、類似於常規的胃鏡檢查，比如消化道損傷、出血、穿孔，術前通過告知患者使患者知情，此類併發症發生的幾率相對較小；

2、跟EST手術相關的比較致命的併發症包括出血，較小的出血在手術過程中處理即可，但是如果是遲發性出血，幾天後出現的大出血，此時可能致命。

3、術後胰腺炎的問題，術後單純的澱粉酶升高沒有問題，但是部分病人可能會發展為重症胰腺炎，可能對患者造成致死性損害。隨著技術發展，術者經驗越來越豐富，操作越來越熟練，此類併發症發生的幾率很少，發生以後會採取相關的措施儘量彌補，減少併發症對機體的損害。