做膽管、膽總管下端的結石，包括胰腺檢查，可應用纖維十二指腸鏡。

胃與十二指腸連在一起，十二指腸分為幾段，到膽與下端匯合處開口插入導管，在X光下面打造影劑可見結石，可將結石取出。假如膽管有狹窄，需擴大開口，打斷肌肉。此方法幾乎無創，可避免開刀。過去膽管內有結石需要開刀手術。即使做微創手術，畢竟也有創傷。用纖維十二指腸鏡可以把石頭很好的取出。基本上技術好的醫生都能夠將石頭清楚乾淨，這樣就避免開刀。所以臨床此方法使用越來越多。