膽總管結石內鏡下微創治療適合1.5cm大小的結石，如果結石大於2cm，內鏡下微創治療難度較大。進行微創手術治療應準備碎石網籃，大於2cm的結石進行體外碎石，然後也應微創治療取出結石。

較多的膽總管結石病人若並不知道結石存在，僅在發生腹痛、黃疸，到醫院就診檢查時發現結石，比如做核磁共振檢查發現病人患有膽總管結石。影像學檢查可以大致評估膽總管結石大小，對於小於1.5cm的結石，可以進行內鏡下微創治療，也叫ERCP手術。結石大於1.5cm，甚至2cm以上，且膽總管結石密度比較高，建議外科手術治療。若結石大於2cm，但密度較低，可以嘗試ERCP微創治療，但是術前要準備碎石網籃，儘量在微創治療下取出結石。微創治療創傷小、恢復快，對病人的打擊更小。所以若患者能在微創治療下取結石，儘量進行微創手術治療。