多數乳腺囊腫可能是乳腺增生或乳腺囊性增生中的一種，患者可能存在大汗腺化生，即夏天出現腋窩汗比較多，這種患者通常伴發雙側乳腺的多發囊腫，一般建議患者觀察，如果特別疼痛，可以服用治療乳腺增生的藥物，常規不建議做手術，如果特別大的囊腫，可以做細針穿刺。

此外，還存在特殊囊腫，比如囊實混合性囊腫、厚壁囊腫以及囊腫有分隔，這種囊腫不建議觀察，需要做穿刺活檢。