一旦發生腦血栓，患者需要快速到相關醫院並且掛神經內科。由於目前醫療水平的進步、醫學技術的發展，各專業的學科劃分趨於精細，腦血栓也不僅是由神經內科的醫生進行診治，但由於患者需明確發病基礎、內科評估等治療腦血栓的基本情況，所以還是建議腦血栓患者首先到神經內科就診，由於血管評估的細化及精準醫療的發展，可以對血管進行詳細評估。

一旦發現血栓的成因，患者需要進行外科手術治療，此時需要到神經外科以及神經外科相關血管外科，甚至包括介入手術科室、導管科室就診。對於腦血栓的患者，可以讓神經內科醫生進一步診斷，判斷是否需要神經外科以及血管外科等相關科室的幫助以及治療。