早期的腦血栓痊癒時間，需根據到達醫院進行溶栓時間，及梗塞大小進行判斷，不是所有患者都能治癒。通常在血栓形成後，3-6個月是自體恢復的黃金時間。如果早期進行溶栓治療，如在發病3-4.5小時內，即可到醫院進行阿替普酶，或尿激酶溶栓治療，血栓溶解後，大部分患者即可很快痊癒。但如果錯過最佳治療時機，需根據梗塞面積、部位進行判斷。

如果發生在腦幹、丘腦、小腦等部位，由於部位較關鍵，會出現較重的臨床表現。如果在基底節區、外囊等部位，這時如果沒有損傷到關鍵的纖維束，且臨床症狀較輕，可以通過適當地康復訓練、早期肢體康復，包括肌肉康復、關節康復，主動或被動進行訓練，及針灸、按摩等方式，則在3-6個月，患者肢體障礙會逐漸康復。