腦血栓若想得到較好的治療效果，一般需要抓緊治療的時間，尤其是在發病3-4.5小時內，如果能夠及時到醫院進行阿替普酶或者尿酶溶栓治療，此時腦血栓的預後效果與耽誤溶栓治療的患者完全不同。大部分患者進行溶栓後沒有效果，還可通過過橋接治療取栓，也可達到較好的效果。因此，腦血栓患者若早期進行溶栓或者取栓，可能完全康復。若失去最佳治療時機，一般可根據以下病因進行治療：

1、動脈粥樣硬化：一般通過他汀類藥物進行治療，如阿託伐他汀、瑞舒伐他汀等，同時需要服用阿司匹林，或者氯吡格雷等抗血小板聚集的藥物。另外還可服用其它輔助藥物，如抗氧自由基的藥物依達拉奉，或者中成藥蚓激酶膠囊等；

2、心源性腦血栓：如房顫或者其它症狀所引起，一般通過抗凝藥物進行治療，如華法林或者其它新型抗凝藥物。

另外在上述疾病過程中，一般通過肢體的康復運動，可避免肌肉或者癱瘓肢體萎縮，或者關節攣縮。