腦血栓後遺症分輕、重，比較輕的後遺症一般可以治癒。腦血栓後遺症期指腦血栓發病1年以後的時期，其恢復速度和程度較恢復期均明顯減慢。腦血栓後遺症專業上稱為腦梗死後遺症，腦梗死後遺症最多見的症狀是一側肢體無力、偏身感覺障礙或者言語功能障礙，也可以有認知障礙、吞嚥困難、平衡障礙、卒中後抑鬱等症狀。一般腦梗死後遺症的治療是在控制危險因素基礎上以針灸康復為主，對肢體無力比較輕微的患者，後期進行康復鍛鍊可以恢復肢體功能，但是對於癱瘓比較嚴重的患者多數會遺留後遺症，很難治癒。

對於後遺症為言語功能障礙的患者，需要加強言語功能訓練，比如讀報、練字等，一般語言功能恢復比肢體功能恢復更困難。在康復訓練的同時，還要建議病人改善生活習慣、飲食習慣，要舒緩壓力，避免刺激，控制血壓、血糖等危險因素，可以增加後遺症恢復的概率。腦梗死後1年內均為康復期或者恢復期，尤其是前3個月恢復效果比較好，如果腦梗死患者能把握好這1年的時間並進行康復，能最大可能恢復身體功能，進入正常生活。