急性腦血栓不是一個獨立的疾病，而是一種臨床疾病綜合徵。腦血栓的形成是一個複雜的過程，目前比較肯定的誘發因素是動脈粥樣硬化。而臨床容易誘發動脈粥樣硬化的原因主要是糖尿病、高血壓、高脂血症、抽菸等，其中抽菸排在第二位。

生活不規律、熬夜、酗酒等也都會加速動脈粥樣硬化，最終導致急性腦血栓。此外，高尿酸血癥、動脈炎以及原發性血小板增多症、原發性紅細胞增多症等血液系統疾病，也是形成急性腦血栓的危險因素。

目前以現有的醫療設備而言，70%-80%的腦血栓都可以找到病因。找到原因後，患者應做好二級預防，避免再次發生急性腦血栓。還有10%-20%的腦血栓找不到原因，是一種不明原因的腦血栓形成。