腦溢血開顱手術之後的後遺症和出血引起的神經功能障礙常重疊和混淆在一起。

腦溢血開顱手術後遺症單純就手術而言，主要包括術後感染、術後癲癇、術後神經功能障礙等。而術後神經功能障礙很大程度上和腦出血本身有一定的相關性，比如手術之後常出現肢體無力，乃至偏癱、偏身感覺障礙、偏盲、完全性的和不完全性的失語、術後癲癇，以及精神改變、性格改變、失眠、健忘等一系列的症狀和體徵。這些情況在手術之後有時在所難免，因為本身腦溢血在急性發作之後，就已經造成了一定程度的神經功能障礙，在這基礎上再進行手術，患者神經功能障礙不一定能夠完全的緩解。

另外更加嚴重的後遺症主要是長期的昏迷，甚至植物生存，以及術後長期臥床引起下肢靜脈血栓、褥瘡等一系列的後遺症。