基底節區出血的後遺症根據其出血的量和部位、治療是否及時和合理，其後遺症不同。輕微的、少量的腦出血，如1-2ml，未達內囊，可無嚴重的後遺症，甚至與出血之前無太大區；如出血量較大，破壞了血腫周圍的神經元細胞，則可導致輕重不一的後遺症，最常見的是肢體偏癱，即出血對側肢體肌力減退，不能活動或活動能力下降，其次是感覺障礙，即出血對側肢體的痛覺、溫度覺消失。此外，還可出現智力障礙或語言功能障礙，吐詞不清或語不答詞。