新生兒脊柱裂小凹是一種嚴重的先天性疾病，對於隱性的脊柱裂沒有神經症狀，不需要特殊的治療，但是如果發現有排尿功能障礙、雙下肢無力等症狀出現的時候，就應該早期手術治療。

對於沒有症狀、表面皮膚完整的脊柱裂可以選擇保守治療，對於表面有皮膚潰爛的，應該控制感染，在創面清潔的時候或者癒合的時候行手術治療，大部分通過手術治療都能達到良好的效果。