松果體區細胞瘤，部分患者有性早熟、腫瘤壓迫的症狀，可以頭痛、嘔吐、侵犯下丘腦出現尿崩或者下丘腦神經症狀。神經系統的症狀主要表現為兩眼不能上視、動眼神經麻痺、眼球運動障礙、共濟失調、瞳孔反射改變，包括阿·羅瞳孔、嗜睡等。腫瘤壓迫四疊體出現瞳孔散大，兩眼球向上視或者下視運動障礙稱為四疊體綜合徵。還可引起小腦共濟失調，內分泌症狀性早熟表現的特徵。有時候因為腫瘤累及上腦室引起植物神經功能障礙，如肢端青紫。還有視力下降，視神經乳頭水腫不太異常。

歸納為三個方面：

1、顱內壓增高可以看到腦積水，病人出現臨床症狀，頭痛、嘔吐、眼底水腫和意識障礙的改變；

2、神經系統症狀，可引起四體Parinaud綜合徵，還可以引起肢體偏癱出現意識障礙。腦積水引起頭顱增大、聽力障礙，腫瘤體積增加時可壓迫四疊體下丘和內側膝狀體，出現雙耳耳鳴和聽力下降。小腦的症狀，腫瘤向下發展可以壓迫小腦上腳或上蚓部引起辨距不良、共濟失調、肌張力降低和意向性震顫。丘腦下部損傷可以引起腫瘤直接侵犯或者播散性種植在丘腦下部所致，症狀可以表現向心性肥胖、嗜睡、尿崩；

3、內分泌障礙，表現在性發育停滯或者不發育，正常的松果體腫瘤可以分泌褪黑色素抑制腺垂體功能，降低腺垂體中促性腺激素的含量和內分泌的減少。