絕大多數的腦癱兒在妊娠期是檢查不出來的，只有因為中樞神經系統發育異常引起的腦癱兒，在懷孕期間可以檢查出來，而且這種情況也不是直接做出腦癱兒的診斷，而是做出中樞神經系統某種形式的發育畸形的診斷，如腦積水。

在懷孕期間，孕婦感染特殊的病毒或者胎盤功能早衰導致胎兒宮腔內缺氧、孕婦服用胚胎毒性的藥物、在分娩的過程中各種原因導致而缺氧窒息或者顱內出血、孩子出生以後患有膽紅素腦病都有可能導致腦癱兒的發生。對於腦癱兒的診斷，主要是依據孩子出生以後的各種異常表現，再結合必要的輔助檢查來作出診斷。