脈絡叢囊腫通常不會引起腦積水。大部分腦積水是因為梗阻引起，腦脊液從側腦室產生之後，通過第三腦室、第四腦室一路向下。脈絡叢囊腫一般不會長在中線部位，不會引起堵牢、阻塞，所以脈絡叢囊腫通常不會引起腦積水，而且脈絡叢囊腫不會長得較大。有些鞍上囊腫、松果體囊腫或後顱窩囊腫長在中線部位，有時會長到3-4cm，但1cm以上的脈絡叢囊腫較少見。

總體而言，脈絡叢囊腫不會引起腦積水等比較嚴重的後果，一方面是基於本身的位置不是長在中線等重要的部位，另一方面是不會長得較大。所以脈絡叢囊腫通常不會引起腦積水，而且一般也不需要處理，預後較好。