腦室腹腔分流堵塞的常見原因分為兩部分，具體如下：

1、腦室端：分流管插入頭顱的部分由於受腦脊液影響，如腦脊液內有感染、腦脊液內部出血或者感染以後，發生蛋白高而引起堵塞分流管出水部分；

2、腹腔端：腹腔內炎症，或者由於個體敏感程度不同，有異物通過手術進到腹腔以後，大網膜可能會起包裹作用，或者由於手術中不清潔，造成局部感染，進而引起包裹。

綜上所述，腹腔端和腦室端都可以由於自身原因，而引起顱內分流管堵塞。