消化不良的治療藥物包括以下幾大類：

第一、抑酸藥物，比如雷尼替丁、奧美拉唑等等。

第二、抗酸藥物，比如氫氧化鋁與鋁碳酸鎂等等。

第三、促動力藥物，比如莫沙必利、伊託必利等等。

第四、胃黏膜保護劑，比如硫糖鋁等。

其它還可以應用消化酶類和微生態製劑等等。如果患者有幽門螺旋桿菌感染，可以向醫生諮詢是否需要根除幽門螺旋桿菌，當然具體的藥物療程和劑量，應該聽從醫生的建議。