蛛網膜囊腫在頭顱CT上表現為比較均勻一致的低密度影，蛛網膜囊腫被蛛網膜包裹，位於腦部，其內部充滿了腦脊液。如果囊腫較小，沒有臨床症狀，囊腫較大時可以對周圍產生壓迫和佔位效應。常見的部位是在枕大池、顳極、松果體等部位，CT上可以在相應部位觀測到低密度影，密度比較均勻，周圍有明顯的分界線。

當對周圍組織產生佔位效應時，可能會使周圍組織移位。比如枕大池囊腫可能會壓迫到小腦，引起頭暈、走路不穩、共濟失調等症狀。如果是透明隔囊腫，有可能擠壓到雙側的側腦室，引起側腦室變小或者狹窄。