腦幹出血術後呼吸不平穩首先要排除氣道因素，檢查有無氣道梗阻表現，可對症使用呼吸機輔助呼吸。如果發生腦幹出血，且這些因素都已排查，還未好轉，可用些激素，針對腦幹出血呼吸不平穩的原因，做些處理措施。腦幹出血呼吸不平穩還來源於腦幹部位的血腫造成的對周圍組織、對呼吸中樞的壓迫。可以用些激素類的藥物進行處理。還有部分患者呼吸沒回來，療效也不會太好，很可能會死亡。