腦幹出血的後遺症與出血量、出血部位密切相關，常見的後遺症有偏癱、失語、感覺障礙、行走不穩、痴呆，甚至導致植物人。患者出血量小且出血部位不關鍵，後遺症較少，對功能影響較小；患者出血量大且出血部位較關鍵，即便能恢復意識，後遺症也較多。臨床上，對於海綿狀血管瘤導致的腦幹出血，手術切除血管瘤即可，預後良好；由於高血壓所致者，應積極控制血壓，減少出血。