龜頭炎用碘伏和高錳酸鉀都不好，因為碘伏和高錳酸鉀都有刺激性，並且可能會對龜頭的皮膚產生一定的燒灼、腐蝕，可能會加重炎症，所以目前治療龜頭炎還是選擇比較溫和的藥膏。

如果是細菌感染引起的可以選擇紅黴素軟膏、夫西地酸乳膏治療，如果是黴菌感染引起的可以用克黴唑軟膏、酮康唑軟膏對症治療，一般兩週左右龜頭炎能好。在塗抹藥膏之前可以用清水或者是溫鹽水清洗龜頭，把局部分泌物清洗乾淨以後再塗抹藥膏效果會更好，治療期間應該要避免辛辣、刺激的飲食，不喝酒，不要發生性行為。