舌咽神經痛主要指舌咽神經分佈區域產生疼痛，病因有以下幾點：

1、原發性舌咽神經痛病因不是特別明確，舌咽神經發出區域受到血管壓迫，導致脫髓鞘的改變，形成神經短路，引發疼痛；

2、繼發性舌咽神經痛主要考慮舌咽神經區域出現腫瘤佔位，或者舌咽神經繞行穿出的莖突過長，壓迫舌咽神經，以及炎症侵蝕誘發舌咽神經痛。

舌咽神經痛是從一側舌根、耳後、扁桃體發出，疼痛呈針刺樣、燒灼樣、過電樣，疼痛性質呈突發、突止。