臨床上經常遇到舌咽神經痛的患者，這些患者表現為一側舌根、扁桃體以及耳後出現陣發樣疼痛，疼痛呈突發突止的表現。臨床上常用治療神經痛類藥物，如卡馬西平、奧卡西平、普瑞巴林、加巴噴丁，營養神經藥物，如甲鈷胺進行治療。

還可以在患者疼痛部位，即舌咽神經發出位置，在超聲引導下給患者進行神經阻滯，將營養神經、消除水腫及炎症藥物注射到舌咽神經位置，遇到比較複雜或者疼痛反覆的患者，還可以進行舌咽神經射頻調節治療。患者日常應注意休息，不要吃過冷、過熱的食物，避免熬夜，放鬆心態，有助於疼痛緩解。