萎縮性胃炎是否嚴重需結合萎縮範圍、萎縮程度、是否有異型增生共同分析，並不是所有的萎縮性胃炎均嚴重。若萎縮範圍只侷限於胃竇，在進行胃鏡檢查時，胃鏡報告上寫明萎縮性胃炎C1期。此時通常不是特別嚴重，C就提示萎縮為局灶性，可分為C1、C2、C3。若為O，說明已經為開放性，包括O1、O2、O3。隨著C1-O3的變化，說明萎縮範圍逐漸變廣。若是O的情況下，說明累及範圍已較廣，萎縮性胃炎嚴重程度也有所增加。

萎縮性胃炎嚴重程度不僅與範圍有關，還與病理程度、是否合併重度腸化以及異型增生等密切相關。若萎縮性胃炎為重度伴有重度腸化，表明癌變率有所增加，甚至高達5%左右。對於此類患者，即為全胃萎縮或重度萎縮伴腸化的患者，應進行密切的胃鏡監測。萎縮性胃炎若伴有異型增生，特別是高度異型增生，此類患者稱為癌前病變。此時需進行內鏡下干預，將出現的高度異型增生病變進行內鏡下去除，患者可以達到治癒。