舌咽神經痛是侷限於咽部、舌根、外耳道區域的發作性劇烈疼痛。藥物治療無效或者效果較差，可以考慮手術治療。手術方法包括舌咽神經痛微血管減壓術、頸靜脈孔區舌咽神經射頻毀損術、神經根切斷術。

不同的手術方法術後均可能出現疼痛復發或者無效，微血管減壓術後95%的患者有效，術後複發率僅5%。短期復發患者可採取射頻熱凝，熱凝無效、疼痛劇烈者可以再次手術。根據具體情況採取減壓術或者舌咽部分迷走神經根切斷術。單純射頻熱凝術後復發患者，可以考慮微血管減壓術。