引起舌咽神經痛的原因包括：

1、部分患者無明顯原因，影像學檢查未見異常；

2、血管壓迫：小腦後下動脈等血管壓迫舌咽神經是引起舌咽神經痛最主要的原因；

3、顱內佔位：如頸靜脈孔區腫瘤、膽脂瘤、腦膜瘤壓迫舌咽神經可引起舌咽神經痛。