絕大多數兒童蛛網膜囊腫沒有症狀，也不需要特殊治療，只要定期複查，觀察囊腫有無變化即可，複查時間為0.5-1年不等。少數蛛網膜囊腫患兒可表現為頭痛，甚至癲癇發作，部分出現囊腫進行性增大，此類蛛網膜囊腫需要手術干預，具體如下：

1、傳統治療方法：進行分流手術，將一根特殊的分流管放入囊腫中，再將囊液分流到腹腔；

2、現代內鏡治療：在內鏡下對囊腫進行開窗治療，將囊腫壁切破，與正常蛛網膜下腔打通，從而使囊腫內液體與蛛網膜下腔液體進行自由交換和流通，以有效治療囊腫。