通常非淋菌性尿道炎患者尿常規是有一定異常的，一般尿常規中可能會出現白細胞增多，甚至是有紅細胞出現的情況。非淋菌性尿道炎是由病原體導致尿道黏膜的炎症感染性疾病，這種炎症感染會導致尿液中的白細胞增多。如果出現尿道黏膜的明顯損傷，甚至可能會出現尿液中紅細胞增多，或者是尿色發紅，尿中帶血，甚至帶血塊的情況。

非淋菌性尿道炎的患者在經過敏感的抗感染治療之後，尿常規的異常情況通常會有明顯好轉，白細胞和紅細胞會減少。另外，非淋菌性尿道炎的患者進行尿培養，有利於幫助明確引起感染的病原體，選擇相應的抗感染藥物。