黴菌性包皮炎，是由於一種真菌性感染所導致的炎症。所以臨床上先要使用抗真菌藥物外用治療，比如可以使用酮康唑軟膏進行局部治療。黴菌性包皮炎往往見於抵抗力較差的包莖，或者包皮過長的患者，所以對於有包皮過長或者包莖的患者，在炎症得到控制的時候，建議去做包皮環切手術，可以使得龜頭外露，從而更好保持龜頭的清潔、乾燥，以減少出現黴菌性包皮炎的機會。

同時，如果男性有黴菌性感染，通過性接觸可能會導致女性也出現黴菌性的陰道炎，會造成夫妻之間的交叉感染，所以對於有黴菌性包皮炎的男性患者，建議性伴侶同時也要去醫院檢查一下，是否存在有黴菌性的陰道炎，夫妻雙方的同時治療，可以避免之後出現反覆的交叉感染。