甲狀腺癌術後復發概率較低，甲狀腺癌中乳頭狀癌與濾泡癌佔到90％-95％，其餘包括髓樣癌、未分化癌、甲狀腺淋巴瘤、鱗癌等，此類患者可能佔5％-10％左右。相對預後較差，容易復發、轉移。

甲狀腺癌的復發與轉移和腫瘤大小、腫瘤術前有無淋巴結或遠處轉移有很大關係，如果腫瘤存在術前淋巴結轉移較多的情況，後期手術以後出現轉移的概率高。此外，遠處轉移特別是濾泡癌，容易出現血行轉移到達腹部、肺部、骨、腦等重要器官。