兒童發生顱內感染，可出現頭痛、嘔吐，甚至意識障礙或顱高壓表現，若不進行治療，可出現血壓突然增高、心率減慢，甚至意識障礙等嚴重症狀，小孩可出現無尿。此時若不及時處理，可導致嚴重後果，甚至發生腦疝而導致兒童死亡，因此必須積極治療，儘早就醫。

此外，顱內感染可造成顱內腦實質損傷，由於腦實質損傷可造成植物人狀態，誘發癲癇發作，甚至導致運動方向、聽力障礙、視覺障礙等。因此兒童一旦診斷或高度懷疑顱內感染，務必到專科醫院儘早明確診斷，積極治療。