胃腸炎與腸胃炎本質上是相同的疾病，主要是症狀為主的部位不同。如果以胃的症狀為主，腸道症狀相對輕，稱為胃腸炎。如果以腸道症狀為主，如腹瀉、腹痛，但同時又出現噁心甚至嘔吐，此時稱為腸胃炎。所以兩者實際上是兩種叫法，但在治療上區別較小。
在急性發作期可能需禁食，症狀稍緩解後可以喝米湯、稀粥。如果有發燒，需區分是病毒性感染還是細菌性感染引起，細菌性感染時需使用抗生素。如果出現噁心、嘔吐，還要加用止吐藥物，如嗎丁啉、胃復安等。如果大便次數較多、腹瀉，可以吃黃連素、香連片、腸胃康等。