腎囊腫5cm一般並不嚴重，但需觀察囊腫位置以判斷，主要分析如下：

1、腎盂出口：如果5cm的囊腫位於患者腎盂出口，即腎盂旁囊腫，可導致患者出現相應症狀，甚至出現腎積水。由於腎盂是腎臟排尿的出口，存在於排尿出口的囊腫可壓迫排尿出口，導致患者排尿不順暢而出現腎積水；

2、其他位置：對於腎臟其他位置出現的5cm囊腫，一般並不嚴重，因為5cm的囊腫一般不會破裂，也不會引起嚴重的症狀。

醫學上對於4cm以上的囊腫，建議進行治療。因為在循證醫學或大樣本的醫學證據上，4cm以上的囊腫會對周圍正常腎臟產生較明顯的壓迫作用，從而影響正常腎組織，因此通常將4cm左右的囊腫作為手術指徵。