患者腎囊腫為5-6cm，通常可進行手術，但並非必須進行。如果患者出現囊腫側腰部不適，囊腫壓迫正常腎組織影響腎臟功能，壓迫集合系統引起腎積水，高血壓症狀考慮與囊腫有關，則需積極進行手術。

如果患者無以上情況，並且經過觀察囊腫無進展，則無需進行手術。但是如果囊腫較複雜，無法排除腫瘤，也應進行手術治療。