腎囊腫一般不會自動消失。腎囊腫包括單純性腎囊腫、複雜性腎囊腫和多囊腎幾個常見的類型。對於單純性腎囊腫，通常囊腫較小無需處理，以觀察為主。囊腫的處理原則如下：

1、如果單側的腎臟囊腫＞3g，囊腫大小＞5cm，向內生長，可能影響到腎臟正常的形態和功能，是需要處理的。處理方法，一種是抽囊液後打固化劑，使囊腫不再長大。第二個是手術，包括去頂減壓、囊腫切除，甚至腎臟的切除；

2、複雜性的腎囊腫：複雜性的腎囊腫主要避免出血感染，複雜性的腎囊腫可能會癌變；

3、囊腫性的腎癌，像是囊性腎癌，表現與複雜性腎囊腫類似，此類病人通常需要行CT檢查，或者增強CT檢查，以判斷囊腫的性質；

4、多囊腎：多囊腎是不可抑制的緩慢的囊腫增大，逐漸的把腎臟的正常形態破壞，然後破壞腎臟的功能，病人出現腎功能不全。此類病人需多飲水，減少腎結石的形成，因為腎結石是導致多囊腎膽囊腫增大的一個原因。還有對於腎功能不全的病人，要進行一些針對腎功能不全的對症治療。

所以腎囊腫不會自動消失，但是可以通過治療來延緩腎囊腫的進展，從而延緩腎臟的壽命，延緩人的壽命。