腎囊腫手術通常為針對單純性腎囊腫進行治療，單純性腎囊腫手術通常採用微創手術的方式，即經皮腎穿刺。因為手術本身所造成的創傷較小，合併症相對較少，故微創手術出院後2-3天即可上班。

若進行開放性手術，切口較大，需縫合較多層肌層，包括脂肪層。通常縫合兩週後才可拆線，拆線後還需恢復1-2周後患者才可上班。