通常較小的腎結石對腎功能沒有影響，除非腎結石造成腎積水，但是短期的腎積水對腎功能的影響有限。如果患者出現長期腎積水，發生梗阻以後，則會逐漸造成腎臟功能受損。

人體有兩個腎臟，如果只是一側腎臟存在腎結石，很多患者並沒有出現任何症狀。另外，腎臟功能受損後，人體內的血肌酐可能依然正常，通過驗血並不能檢測出腎臟功能是否受損。此時患者需要進行GFR測定，從而明確腎臟的功能是否受損。