腎結石碎石對腎可能會造成輕微損傷，並不是完全無創，腎結石碎石通常分為以下幾種方式：

1、體外碎石：又稱為體外衝擊波碎石，是將能量聚焦以後傳輸到體內，除了碎結石以外，周邊的腎臟組織會受到不同程度的能量衝擊，手術以後患者會出現血尿、疼痛等症狀，一般不會過於嚴重，腎臟通過2-4周的時間能夠基本修復，體外碎石需要要限制次數，一般需要控制在3次以內，過多次數頻繁碎石可能導致腎臟血腫，甚至腎臟破裂等嚴重併發症；

2、體內碎石：又稱為手術碎石，一般使用輸尿管軟鏡或經皮腎鏡進行操作。經皮腎鏡需要在腎上打一個通道，對腎臟會造成一定損傷，軟鏡雖然對腎臟本身沒有直接的創傷，但軟鏡可能造成激光的高溫與碎石迸濺，也會導致輕微損傷。

碎石會對腎臟造成一定損傷，多數比較輕微，對於去除結石、緩解腎積水而言，上述的代價通常可以承受，通常利大於弊時才會進行手術。