百多邦能治龜頭炎，且效果較好，該藥是一種含有抗生素組分外用藥膏，並且殺滅革蘭氏陽性菌的效果理想。另外，臨床除百多邦外，患者首選抗菌素效能持平，但對陰莖頭黏膜、包皮黏膜刺激性溫和的藥物，比如紅黴素軟膏或紅黴素眼膏。

對於特殊、嚴重的龜頭炎患者，可能使用百多邦、紅黴素效果較差，可以考慮做包皮環切手術、口服抗生素配合治療，比如頭孢類、磷黴素類、喹諾酮類藥物。通常口服藥物使用配合局部藥物應用，有利於控制龜頭炎，達到理想的治療狀態。若患者存在較罕見的嚴重龜頭炎，出現破潰、化膿、流膿，建議外用藥物聯合靜脈輸液治療控制感染。