紅黴素軟膏通常用於體表感染，也可以用於龜頭的外用。但是需要注意如果龜頭炎症滲出液比較多，不要選擇紅黴素軟膏以免影響分泌物排出，加重病情。滲出較多通常不建議用膏劑。此外，黴菌性包皮龜頭炎亦不能使用紅黴素軟膏，以免加劇黴菌性包皮龜頭炎症狀，甚至引起病情的加重。此外，紅黴素軟膏不能夠塗抹在尿道以內，因為尿道以內的黏膜比較敏感，如果用紅黴素軟膏會引起尿道的狹窄。因此，紅黴素軟膏用於包皮龜頭炎並不是禁忌症，但是一定要規範的用藥。