主動脈縮窄手術具有一定危險，主動脈供應全身血液，如同電路，出現異常後，冰箱裡食物就會過期，電視不能觀看，網絡也不能連接，因此人可出現煩躁及焦慮情緒。主動脈縮窄手術花費時間較長、創傷較大，具有一定風險，手術死亡率約為0%-4%，死亡原因為出血和心功能不全。

但若患者不進行手術，90%患者可出現心力衰竭或縮窄段遠、近端瘤樣擴張，形成動脈瘤、心臟內感染或出現腦出血，患者壽命一般不超過50歲。現統計主動脈縮窄平均壽命在30-40歲間，若患者狹窄段兩端壓力出現22.5mmHg階差，需立即進行手術。