吃南瓜通常不會造成便秘，南瓜含有較多膳食纖維，以及糖分、維生素、礦物質等，便秘患者可以適當進食。南瓜內含有的膳食纖維，對於腸道蠕動有幫助，因為自身的消化酶不能降解膳食纖維，膳食纖維進入腸道後能吸收水分，使大便不幹硬。另外膳食纖維吸收水分後，會出現一定程度的膨脹，使得大便體積容量增加，會對腸壁產生溫和的刺激，容易產生排便反射。

膳食纖維本身進入腸腔後，可以在腸腔內細菌的作用下進行降解，產生較多小分子化合物，如丁酸、丙酸、乙酸等，存在較多的生物學功能，可能會刺激腸蠕動增加、改變腸道微生態環境，有利於益生菌增長。所以吃南瓜對腸道動力恢復和腸蠕動均有一定好處，在大概率上可以促進排便，通常不會造成便秘。少數人吃南瓜後出現便秘，目前機制並不明確，患者可以儘量少吃南瓜。