腎移植的排斥反應是由於人體有健全的免疫系統，能夠監測進入機體內的抗原，包括腎臟外來的異種移植物，都會作為抗原被機體的免疫細胞識別，會產生相應的抗體進行攻擊，攻擊之後就會將抗原進行清除。

如果腎移植術後出現急性的排斥反應，腎臟會在短期之內失去生理功能，被機體排斥掉。如果是慢性的排斥反應，有很多年的時間，腎臟逐漸地出現功能衰竭，最後也會喪失功能。因此腎臟移植手術建議在親屬之間進行移植，因為移植術後這種情況大多數都是慢性的排斥反應。但是不管何種腎臟進行移植，移植術後出現排斥反應是持續存在的，慢性排斥反應貫穿在整個腎臟移植術後的手術當中。排斥是人體免疫系統對外來的抗原的一種清除作用，除非人體免疫系統被打破了，沒有健全的抗原識別能力，比如人體獲得了艾滋病，這個時候不會出現排斥反應。