引起甲狀腺囊腫的原因有很多，大致有以下幾個方面：

1、可能與不良的生活方式和飲食習慣有關，比如患者經常吸菸、飲酒、過度的應酬、熬夜工作，以及其它不健康的飲食習慣，包括暴飲暴食，經常吃油膩的食物以及其它不健康的食品等；

2、甲狀腺囊腫的發生也與情緒有關，在中醫理論當中甲狀腺囊腫發生的原因主要是因為肝鬱化火，導致肝鬱氣滯，從而出現痰瘀互結、氣血運行不暢，而形成氣滯血瘀、痰凝於頸前，從而發生甲狀腺囊腫；

3、也可能是因為缺碘所導致的甲狀腺囊腫，碘元素是甲狀腺必不可少的一種物質，如果缺乏，可能會導致甲狀腺腫以及甲狀腺其它一系列的問題，而甲狀腺囊腫與碘的缺乏也有密切的關係，所以碘缺乏也會導致甲狀腺囊腫。