無痛胃腸鏡是國內近幾年比較新興的檢查方式，是針對於常規胃腸鏡檢查而言。無痛性的胃腸鏡檢查需要多科進行協作，不但需要消化科的大夫進行胃鏡操作，而且需要麻醉科大夫進行胃腸鏡前的篩查和麻醉評估，還需要根據患者的心肺功能和呼吸情況，特別是患者的心髒功能，受到年齡、體質、狀態的影響。如果患者有心臟病、高血壓、糖尿病等嚴重的內科疾病，麻醉醫生評估可能的費用以及術中進行的費用就會較高。不同區域、不同級別、不同治療水平的醫院的檢查費用一般會有一定差別。患者如果是胃鏡加腸鏡同時做，一般在2000元左右，部分私立醫院的收費甚至可以達到10000元。